Информационно-аналитический отдел
Обеспечивает решение аналитических задач по проблеме образования людей с РАС и ТМНР в крае, реализует просветительские программы и мероприятия, обеспечивает деятельность специального портала по проблеме РАС и ТМНР.
Учебно-методический отдел
Осуществляет методическую поддержку по вопросам оказания комплексной помощи лицам с РАС и ТМНР; создает методические продукты, разрабатывает и реализует программы повышения квалификации, стажировок педагогических работников, организует подготовку и проведение научно-практических семинаров, вебинаров и конференций.
Консультативно-диагностический отдел
Проводит диагностику сложных случаев, осуществляет правовую, психологическую и методическую поддержку родителей и людей с РАС и ТМНР, разрабатывает рекомендации для осуществления коррекционной работы в крае.